malva.cli module

malva.cli.get_index_parser()

malva.cli.setup_index_parser(parent_parser)

malva.cli.cmd_run_index(args)

malva.cli.get_show_parser()

malva.cli.setup_show_parser(parent_parser)

malva.cli.cmd_run_show(args)

malva.cli.get_quant_parser()

malva.cli.setup_quant_parser(parent_parser)

malva.cli.cmd_run_quant(args)

malva.cli.get_cellxmer_parser()

malva.cli.setup_cellxmer_parser(parent_parser)

malva.cli.cmd_run_cellxmer(args)

malva.cli.get_autoannotate_parser()

malva.cli.setup_autoannotate_parser(parent_parser)

malva.cli.cmd_run_autoannotate(args)

malva.cli.get_combine_parser()

malva.cli.setup_combine_parser(parent_parser)

malva.cli.cmd_run_combine(args)

malva.cli.get_serve_parser()

malva.cli.setup_serve_parser(parent_parser)

malva.cli.cmd_run_serve(args)

malva.cli.get_search_parser()

malva.cli.setup_search_parser(parent_parser)

malva.cli.cmd_run_search(args)

malva.cli.cmdline_args()

malva.cli.cmdline_parser()

malva.cli.cmdline_main()